Doktori I cili merret me diagnozën e fibromialgjisë është një mjek që bën një diagnozë të mirë diferenciale, pasi fibromialgjia mund të ketë simpotma të përafërta me sëmundje të tjera kronike apo të jetë komorbide (pra bashkëshoqëruese) si:
- sindroma e lodhjes kronike;
- sëmundja inflamatore e zorrëve,
- lupusi
- artriti rheumatoid, etj
- hiperteroidizem
- apnea e gjumit
- semundja laim